Ante los hechos de violencia, Querétaro podría perder la categoría y ser parte de los equipos que han sido desafiliados de la Liga MX.
En diversas ocasiones, equipos del fútbol mexicano han perdido la oportunidad de mantenerse en el máximo circuito.
Colibríes
Un equipo de Morelos que duró poco en el máximo circuito ya que su dueño no pudo cubrir sus gastos, terminó desafiliado y desapareció en 2003.
Irapuato
Al pasar de 20 a 18 equipos, algunos salieron perjudicados y fue el caso de los freseros que por falta de pagos y el otro equipo fue precisamente los Gallos de Querétaro.
Querétaro
En dos ocasiones ha perdido la categoría por dificultades con su anterior dueño, pero lograron mantenerse luego de comprar la plaza en el máximo circuito.
Jaguares
Tras consumarse el descenso del equipo en Chiapas, falta de pagos e irregularidades hicieron que desapareciera el equipo en 2017.
