Javier Aguirre tiene una historia mágica dentro del futbol europeo, debido a que, en todos los equipos, o en su mayoría ha hecho cosas memorables, llegar a instancias en los clubes de Europa en los que ha dirigido a lo largo de su trayectoria.
Desde su llegada hace más de 20 años con el Osasuna de Pamplona comenzó a tener cimientos de éxitos como entrenador. Ahí, en el conjunto de Osasuna llegó a la Final de la Copa del Rey en 2005, pero esta no fue la única final o el logro más grande.
Debido a que también estuvo en la zona de clasificación previa de la Champions League, sin embargo, no pudo clasificarse a la fase de grupos, además de poner al equipo de Pamplona en la Copa de la UEFA, que actualmente es la Europa League.
Con Atlético de Madrid a su llegada en 2006 logró ponerlo en Champions League, actualmente es muy común, sin embargo, en ese momento logró clasificarse después de 12 años de ausencia del cuadro de Atlético de Madrid.
Aunque en menor medida, Javier Aguirre suma dos equipos a los que ha salvado del descenso en el último tiempo, debido a que Real Zaragoza se salvó en 2011, pero también con el equipo de Mallorca en el año de 2022.
